内蒙古医科大学附属医院胸外科专业始建于1960年，是我区成立胸外科专业最早的单位。经过多年的发展，胸外科的科研和临床技术水平已处于国内先进水平，是内蒙古自治区医疗卫生领先学科。胸外科承担着内蒙古医科大学的硕士研究生、医学生的教学和临床技能培训，是硕士研究生学位授予点。胸外科设床位45张，5张重症监护病床，拥有胸腔镜、纵隔镜、纤维支气管镜、超声刀、呼吸机等先进仪器设备。担负着全区胸部常见病、多发病、疑难和急危重症的诊治和抢救，年住院1300余人次，年完成胸外科手术500余例，其中15％为胸腔镜手术，是自治区内年治疗人数、年完成手术例数、年完成胸腔镜手术例数最多的胸外科。开展多项国内先进的新技术、新业务和高难手术，是卫生部确定的自治区内唯一的可以实施肺移植临床基地。
    胸外科现有医师12人，其中教授、主任医师4人，副主任医师1人,主治医师3人，住院医师4人；博士3人，硕士7人；硕士生导师5人（护理专业1人）。1人入选内蒙古自治区“新世纪321人才工程”二层次人选。1人担任中国医师协会胸外科分会微创专业委员会委员，1人担任中国抗癌协会肺癌专业委员会青年委员，1人担任中华医学会胸心血管外科分会青年委员，1人担任中国医师协会胸外科医师分会常委， 1人担任内蒙古医学会胸外科分会主任委员，3人担任内蒙古医学会胸外科分会常委。有3人次担任《中国肺癌杂志》、《内蒙古医科大学学报》、《内蒙古医学杂志》编委。科室与国内许多知名医院胸外科有合作关系，还聘请一名国内著名专家担任我院胸外科特聘教授。胸外科坚持临床与基础结合，重视应用基础研究与人才培养。近年来，承担或完成厅局级、省部级等科研项目9项，获内蒙古自治区科技进步三等奖1项，发表论文100余篇，SCI收录3篇。已培养胸外科硕士研究生10人。
　　胸外科主任 郭占林
　　胸外科副主任 梁俊国
　　胸外科护士长 王贵桃

　　服务项目
　　肺部疾病的诊断和治疗：包括肺癌、肺部转移瘤、肺良性肿瘤、肺化脓症、支气管扩张症、肺包虫、肺囊肿、肺气肿等。
　　食管、贲门疾病的诊断和治疗：包括食管癌、贲门癌、贲门痉挛、食管平滑肌瘤、食管穿孔和破裂、食管裂孔疝、食管憩室、食管烧伤等。
　　纵隔肿瘤的诊断和治疗：包括胸腺瘤、重症肌无力、畸胎瘤、神经纤维瘤、心包囊肿、气管支气管囊肿、食管囊肿等。
　　膈肌疾病的诊断和治疗：包括膈疝、膈膨升、膈肌肿瘤等。
胸壁疾病的诊断和治疗：包括胸壁结核、漏斗胸、鸡胸、肋软骨炎、胸壁骨骼肿瘤和软组织肿瘤等。
胸膜疾病的诊断和治疗：包括脓胸、气胸、乳糜胸、胸膜间皮瘤等。
　　气管肿瘤的诊断和治疗。
　　胸部外伤及复合外伤的诊断和治疗。　　
　　可行胸腔镜手术的疾病包括：自发性气胸及肺大泡；肺部小肿物的诊断与治疗；肺癌的肺叶切除、淋巴结清扫术；肺良性疾病；较小的胸腺瘤及胸腺切除术；胸膜活检及肺活检；纵隔肿瘤；胸外伤的诊断与治疗。
高难胸外科手术：包括肺移植、上腔静脉人工血管置换术、肺减容术、气管和隆突切除重建术、结肠代食管术等。

　　特色诊疗项目
　　1. 胸腔镜手术
　　在保证手术疗效的前提下，开展胸腔镜手术，仅需要在胸壁上作2－3个小孔，具有手术切口小美观、创伤小、疼痛轻、术后恢复快等优点，能完成大部分需要常规开胸治疗的胸部手术，包括纵隔肿瘤、气胸、急性脓胸、胸外伤及部分食管癌和肺癌、胸膜和肺活检等。
　　2. 肺癌、食管癌贲门癌、纵隔肿瘤等胸部肿瘤的手术及综合治疗
　　注重肺癌、食管癌、纵隔肿瘤等胸部肿瘤的规范治疗和综合治疗。胸外科依托内蒙古医科大学附属医院强大综合实力和齐全临床学科的优势，充分发挥综合性医院胸外科的优势，相继开展了一系列高难度的复杂手术，如支气管袖状肺叶切除术、支气管袖状+肺动脉袖状肺叶切除术、上腔静脉人工血管置换术、气管隆突成形术、结肠或空肠代食管的食管癌根治手术等。同时，十分注重肿瘤的规范化、综合治疗，充分发挥综合医院先进设备和技术优势。我院拥有先进的肿瘤医疗设备包括PET-CT、直线加速器、伽玛刀、射频消融、介入治疗设备等，使术前、术后的肿瘤患者及晚期的肿瘤患者都能得到最合适的治疗，满足不同状况肿瘤患者的治疗需要，更好地为肿瘤患者服务。
　　3.重症肌无力的外科治疗
　　胸腺增生和胸腺瘤与重症肌无力发生密切相关。我科开展胸腔镜下胸腺切除加前纵隔清扫手术治疗重症肌无力，取得了良好的疗效，并对围手术期的合理用药及术后重症肌无力危象等并发症的防治等作了开拓性的工作，取得了丰富的临床经验。对胸腺切除治疗重症肌无力的机理作了深入的研究，并在重症肌无力的诊断、治疗等方面做了大量应用基础研究和临床研究，研究成果获得省级科技进步奖。